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第一个整合的人类肺细胞图谱提供了对肺部疾病的见解

人类肺部最大、最全面的细胞图谱于 6 月 8 日发表在《自然医学》杂志上。人类肺部细胞图谱揭示了肺部细胞类型的巨大多样性以及健康与疾病之间的关键差异,将成为肺部的宝贵资源研究人员。

通过结合近 40 项研究的数据,研究人员创建了第一个完整的肺部单细胞图谱,揭示了罕见的细胞类型并突出了健康人之间的细胞差异。此外,该研究发现了肺纤维化、癌症和 COVID-19 之间的共同细胞状态,为了解肺部疾病提供了新方法的新方法,这可能有助于确定新的治疗靶点。

该研究是全球人类细胞图谱 (HCA) 计划的一部分,该计划旨在绘制人体中的每种细胞类型,以改变我们对健康、感染和疾病的理解。

肺部研究极大地受益于最近的单细胞研究,这些研究表明哪些基因在每个细胞中是活跃的。尽管如此,到目前为止,这项研究受到每项研究的样本数量和个体数量的限制。为了更好地了解健康的肺部并确定疾病出了什么问题,需要一个全面的图谱,但这很难实现。

现在,一大批研究人员使用高级机器学习成功地将 49 个肺部数据集组合成一个集成图集。通过汇集和整合迄今为止发表的每项主要单细胞 RNA 测序肺研究的数据集,该团队创建了第一个整合的人类肺细胞图谱。该图谱涵盖超过 240 万个细胞,并提供了以前不可能实现的肺生物学新见解。

该论文的资深作者、德国慕尼黑亥姆霍兹计算生物学研究所和肺健康与免疫研究所的组长 Malte Luecken 博士说,“一个全面的器官图谱需要许多数据集来捕捉两者之间的多样性细胞和个体,但结合不同的数据集是一个巨大的挑战。我们开发了一个基准测试管道,以找到将所有数据集整合到 Atlas 中的最佳方法,使用人工智能,并成功结合了近 40 项先前肺部研究的知识和数据。 “

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